在南京注冊的高新技術企業的審批材料分為兩部分，第一部分是審查認定，第三部分是公示和發證。
南京注冊公司(1)在確認政府機構已收到企業申請材料后，根據新技術的各個領域，從專家庫中隨機抽取不少于5名相關研究人員，通過互聯網管理所有電子材料(隱藏企業身份數據)接收入選研究人員。
(2)政府機構在收到研究人員的高度評價意見和中介機構的專項審核意見后，提出對申請企業的認定意見，確定高新技術企業認定名單。
上述管理工作應在收到企業申請材料后60個工作日內完成。
被認定的高新技術企業應當在“高新技術企業認證管理網”上公布15個節假日。
公開投票的，填寫《政府機構認定高新技術企業核準備案匯總表》，報辦公室副主任備案，在“高新技術企業認定管理網”上發布新聞稿，由認定政府機構頒發《高新技術企業證書》(加蓋高新技術、金融、金融機構印章)。
綜上所述，按照明確的規定，完成整個程序大概需要75天假期。
高新技術企業資質應當在證書頒發之月內公布，有效期為三年。理論上，高新技術企業的有效期是三年！
有效期過后，無需先認定高新技術企業，但可以重新審核。根據高新技術企業認定管理指引，企業應在高新技術企業資格期滿前三個月內申請復審。未申請復審或者復審不合格的，其高新技術企業資格到期制度將過熱。
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