可以說，效益是每一個網絡公司注冊的企業的首要目標，小規模納稅人企業也是如此。但是，針對小規模納稅人的稅務籌劃是一項專業性的操作，稍有處理不當就有可能給企業帶來納稅的可能，從而對企業管理的長期可持續發展產生負面影響。
一方面，小規模納稅人不必像大企業那樣按投入產出的差額繳納，而是按營業額的3%征收，不扣除產出，因此小規模納稅人的稅收籌劃不能在投入上“作弊”。所以要走這條路，只能少周轉，需要少開發票。到目前為止，這種方法經常被一些企業采用。另一方面，從企業個人所得稅的角度來看，企業個人所得稅是按照銷售收入扣除成本和各種費用后計算的。所以規劃可以從成本和支出兩方面來進行。但是，在采用這種方法時，要注意成本不能隨便擺弄。如果調整過低，企業的收益就會過低甚至虧損。這時候更容易引起稅務的注意。一旦稅務被查或被審計，企業更容易觸發征稅的可能性。所以成本不要隨便亂動，而各方面費用“大驚小怪”比較穩妥。
其次，小規模納稅人還可以在稅率的各個方面進行適當的節稅。很明顯，可以采用以下兩種方式:(1)銷售商品時，可以采取回網絡公司登記的立場，避免收現金不想要月發票的業務，記入活期賬戶，或者不必記入賬戶。(2)在采購貨物時，即使沒有每月的采購貨物發票，連也要使費用有設施發票，這樣可以增加成本，降低三個效益。一般來說，小規模納稅人的納稅籌劃只能通過以上兩種方式進行。
但稅收籌劃是一項非常專業的操作，具有合法性、計劃性、意識性、風險性、學術性等特點。
小規模納稅人的納稅籌劃是一件很專業的事情，處理不當會面臨很大的可能性。所以在做小規模納稅人稅務籌劃時，需要找一個對公司有專業全權的公司，以避免一些避稅的可能。