與普通發票相比，增值稅發票可以抵消公司的銷項稅，大大降低公司的成本。但并非所有增值稅專用發票都可以抵扣銷項稅。
增值稅專用發票具備以下條件時，不能抵扣銷項稅。
1.
發票不一樣
鑒于“資金流”、“發票流”、“貨流”不完全一致，如果貿易公司沒有登記增值稅發票，將扣除銷項稅。
2.
不審核發票
在公司的長期經營管理中，公司開具的增值稅專用發票往往達不到要求。這樣公司的銷項稅就不能抵扣了。如果要扣公司的銷項稅，必須出具審計發票。違規行為包括稅號正確、發票注銷、金額正確、雜亂無章、公司字幕難、明細不全、虛開發票等。
三
簡單計劃法開具的發票
公司購買的運費或勞務派遣的稅務發票、免稅發票、員工福利發票、個人消費發票，職工或個人消費的運費或應稅勞務的增值稅專用發票，以及相應的運輸費用和免稅運費銷售的運輸費用不可抵扣。但如果購買的機器人、機器、車輛等人民幣用于員工福利和增值稅繳納項目，可以抵扣進項稅。
如果購買的產品用于員工福利，則不能用類似發票沖抵，如中小企業購買的廁所、水、烤箱等。
但同一項目指定用途不同的，可將憑證由不可抵扣改為可抵扣。
4.
待認證的發票
增值稅專用發票開具后個月內
一百八十度
未在當月內向稅務機關提交增值稅發票憑證，或證明貿易公司注冊的錢明不完全一致，或證明可抵扣增值稅發票未在次月的批準月份內獲得批準。
5.
購買公共服務增值稅專用發票
通過納稅方式購買的利息公共服務、休閑公共服務、旅游服務、貨運公共服務、勞務配件，即使取得增值稅專用發票，也不能抵扣。
6.
營改前的增值稅專用發票，營改后不得使用