根據《中華人民共和國企業所得稅法》第五十條第二款的規定，居民企業在中國境內設立的不具有法人資格的營業機構，應當匯總計算繳納企業所得稅。
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一、跨地區經營合并納稅企業的分支機構
《國家稅務總局關于印發的公告》(國家稅務總局公告2012年第57號)第二條、第三條規定，在中國境內跨地區(指省、自治區、直轄市和計劃單列市)設立居民企業。不具有法人資格的分支機構、居民企業是跨地區經營的合并納稅人。除另有規定外，企業所得稅實行“統一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算”
(1)統一計算。【/s2/
(2)分級管理。總公司和分公司受當地主管稅務機關的管理。因為總機構和分支機構所在地的主管稅務機關負責地方機構的企業所得稅管理。
(3)預付款到位。【/s2/】根據當地法律法規，總行應按月或按季向當地主管稅務機關報告企業所得稅預繳情況。
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(4)簡易清算。【/s2/】是指年末后，總行對應稅企業的年度應納稅所得額和所得稅進行計算匯總，將當年總行和分支機構預繳的企業所得稅分期沖減，然后多退少補。
(5)資金轉移。【/s2/】財政部根據批準的系數，定期調整從繳入中央國庫的合并企業所得稅向地方國庫分配的收入。
根據第十條的規定，征收稅款的企業應當在年度終了后五個月內，計算總機構應繳納的年度所得稅，扣除總機構和分支機構已預繳的稅款，計算總機構和分支機構應退稅款，然后按照本辦法規定的分稅制計算總機構和分支機構應退稅款，由總機構和分支機構當場辦理納稅或退稅。
綜上所述，對于跨地區合并納稅企業，其不具有法人資格的分支機構應按季度和年度辦理企業所得稅申報表。
二.非跨地區合并納稅企業分支機構
對于總分支機構和辦事機構設在同一地區的合并納稅企業，本著方便納稅人納稅、提高征管效率的原則，統一匯總到總行計算繳納企業所得稅，分支機構無需辦理季度和年度企業所得稅申報表。
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