1.個人“代理記賬公司”無代理記賬專業知識(經市財政局批準的公司股權轉讓的會計許可證和會計憑證等。)，可以規避法律責任，損害委托單位的個人利益。這也是中小企業在選擇聯邦快遞時必須注意的。
2.對于一些代理記賬，公司沒有與委托單位簽訂月度委托代理合同，對兩國的基本權利和責任缺乏具體明確的規定。在具體的管理工作中，往往很難分清法律責任。因此，企業在選擇代表公司時應該更加謹慎。
3.會計信息傳遞困難，監管不夠。代理記賬單位在接受委托單位的原始會計憑證和資料時，不同時辦理交接手續，如有遺失或損壞，難以查明。
4.財務軟件需要在財政局備案后才能使用。一些記賬機構沒有采用司法部批準的財務軟件來代替流程記賬。
5.一般來說，代理記賬是一種不定期或定點的上門服務，日常業務可以通過電話號碼進行溝通。會計不是由公司股權轉讓在任何時候同時持有和討論的業務。
一方面是政策要求，另一方面是企業需求，所以企業委托代理記賬已經成為一定的發展趨勢和專業知識
還可以使企業第一時間了解財務運行情況，保證資金的穩定和安全，隨時為企業領導解答稅務問題，滿足企業對人事管理的需要。