為貫徹落實黨的十九大調研報告中的信念，商務部個人所得稅司組織編制了《有限責任公司注冊資本1.0版R&D費用加計扣除實施指引》，幫助企業更好地享受政策優惠，激發企業創新魅力。
首先，享受R&D費用加扣除政策的會計要求
企業需要注意的是，稅[〔2015〕119號文件對研究開發費用的會計核算提出了幾點要求:
1.遵守國家研究院整合的會計準則:企業應當按照國家研究院國際會計制度的要求對研發支出進行會計處理。
2.設立研發支出輔助賬戶:對于享受附加扣除的R&D費用，根據R&D項目設立輔助賬戶，在核算前夕準確收取每筆可加可減的R&D費用的具體金額。如果一個企業在一個有報酬的年度內進行了多次R&D及娛樂活動，則應單獨收取R&D費用，該費用可根據不同的R&D項目進行扣除。
3.分別核算R&D和制造:企業應分別核算R&D費用和制造經營管理費用，并準確、恰當地收取所有費用。劃分不清的，不予扣除。
97號新聞稿對監督企業設立研發支出輔助賬戶作了簡化明確的規定，以幫助企業防范相關可能性:
1.國家發展改革委R&D項目辦為R&D分公司注冊資本設立輔助賬戶，由企業留存并核準。
2.企業可參照97號新聞稿所附樣式，設立研發支出輔助賬戶，編制研發支出輔助賬戶匯總表。
3.年初統計研究應填寫研發支出輔助賬戶匯總表，并將年度國際會計調查報告連同附注報送主管稅務機關。
二、共用人員和計量器具、電子設備、資產核算要求
在一些企業，特別是企業，從事R&D和娛樂活動的員工還將承擔制造、經營和管理等責任。用于R&D和娛樂活動的測量儀器、電子設備和資產也將用于非R&D和娛樂活動。國稅發〔2015〕119號文件仍強調“專用”，允許額外扣除R&D費用。為了有效地對這種情況進行分類，企業應對這類員工的娛樂活動以及計量器具、電子設備和資產的使用進行適當的記錄，并按照具體最低工資的比例在R&D費用和制造經營管理費用之間以特定方式重新分配相關費用，未重新分配的不得扣除。
三.R&D合作伙伴項目的會計要求
國稅發〔2015〕119號文件明確規定，企業共同開發的工程項目，各合伙人應根據各自的具體R&D費用，計算并扣除有限責任公司的注冊資本。企業與合伙人合作開發的工程項目，合伙人應當按照《企業(合伙人)研究開發大型項目書》和《注冊產品開發(合伙人)合同》的約定，設立合伙人R&D支出輔助賬戶，其承擔的R&D費用應當按照會計要求由工程項目核算，并按照R&D費用的收取范圍單獨計算扣除。
第四，R&D費用的核算必須在機構間進行協調
R&D費用的核算需要大量的準備和管理工作，如R&D費用加扣除政策所要求的留存和審批資料，以及與公司決議、R&D合同、會計賬簿、相關科研成果等有關的資料。，所以需要R&D和企業的財務部門密切合作。如果各機構未能有效配合，導致信息和會計憑證不完整，會計核算不原始，將對R&D費用的核算和外商投資的享受產生負面影響。